A FUJB apoia instituições de ensino, ciência e tecnologia do Brasil por meio da gestão administrativa e financeira de projetos de ensino, pesquisa, extensão, desenvolvimento institucional e prestação de serviços técnicos realizados por estas instituições.

A FUJB estabelece contratos, convênios, recebe patrocínios, doações, faz compras, importações, licitações, obras e demais operações necessárias à realização dos projetos. A FUJB também atua de forma filantrópica apoiando projetos e iniciativasde entidades sem fins lucrativos.